Mauniemi on aiemmin kuulunut Koveron suurtilaan. Se mainitaan eri lähteissä lampuotitilana, rusthollina ja sotilasvirkatalona (omistajalta saatu tieto: 1809 kartassa siitä käytetään nimitystä Kovero Yli joki rusholl.

Arajärven Messukylä ym. historiassa se mainitaan Koveron lampuotina. Hämeen ratsurykmenin joissain papereissa se taas mainitaan sotilasvirkatalona). Rakennukset ovat alun perin sijainneet Koveronsalmen nykyisen sillan lähellä olevalla mäellä. Jyväskylän lyseon lehtori K. A. Kovero siirsi rakennukset nykyiselle paikalleen 1900-luvun alussa. Häneltä paikka siirtyi hänen pojalleen, tilastollisen toimiston johtajalle Martti Koverolle 20-30-lukujen vaihteessa, ja tällöin päärakennuksessa tehtiin suuri remontti, jonka yhteydessä rakennus mm. laudoitettiin. Vintti on tämän remontin jälkeisessä asussa.

1900-luvulla Mauniemi on toiminut pääsääntöisesti kesäasuntona, mutta sota-aikana ja sen jälkeen siellä on myös asuttu pysyvästi. Asuinrakennuksessa on tehty sisätilaremontti 40-50-luvulla, jolloin salin ja sen peräkamarin kiinteää sisustusta muutetettiin ja väliovet uusittiin.Uusi kuisti (lasiveranta) on rakennettu 60-luvulla.