Ensimmäinen Kaakilaan viittaava maininta kirjallisissa lähteissä on vuodelta 1510, jolloin lähteissä esiintyy nimi Oluf Kackij (Vahtola 1996, 37). Suomen Asutuksen Yleisluettelossa Kaakila mainitaan jo aivan ensimmäisessä jaksossa 1540 - 1559. Kaakilan ja Junnilan kylissä oli tuohon aikaan yhteensä 8 taloa: Hara, Kokkola, Kurikka, Rankki, Marttila, Jyskä, ltilä ja Taikka (Say 1540-1559). Nykyään Kaakilan kylätontti sijaitsee kahden tilakeskuksen, Haran ja Kokkolan alueilla, ja Haran puolelle on tehty 2014 uudisrakennus. Historialliseen kylätonttiin liittyvien arkeologisten kerrostumisen säilyminen tai esiintyminen tällä puolella kylätonttia on epätodennäköistä. Sen sijaan Kokkolan tilan rakennuksen ovat pääosin vanhoja ja kevyesti perustettuja, ja tällä alueella historialliseen kylänpaikkaan liittyviä kulttuurikerroksia on ollut mahdollista säilyä.