Isojakokartan v. 1791 mukaan paikantuva Mouhijärven vanhan kirkon paikka sijaitsee edelleen käytössä olevalla hautausmaalla, mäen laella, kellotapulista n. 25 m länteen. Karkun seurakuntaan kuulunut Mouhijärven kappeli perustettiin v. 1592. Vuonna 1642 paikalle rakennettiin kolme vuotta aiemmin perustetun Mouhijärven itsenäisen kirkkoherrakunnan ensimmäinen varsinainen puukirkko. Rakennus toimi seurakunnan kirkkona v. 1878 asti, jolloin uusi tiilikirkko otettiin käyttöön. Vanha puukirkko purettiin v. 1878. Kirkon kivijalka on ennallistettu todennäköisesti 1960-luvulla.