Kaavan vaikutusten arviointia on pidettävä edelleen puutteellisena. Arkeologisen kulttuuriperinnön osalta arviointi puuttuu kokonaan ja muun kulttuuriympäristön osalta kaavan todelliset, mm. uudisrakentamisen myötä syntyvät vaikutukset jäävät huomioimatta. Myös yksittäisten rakennetun ympäristön arvokohteiden osalta arviointi jää keskeneräiseksi. Muinaismuistolain rauhoittamista kohteista selostuksen sivulla 41 mainitaan vain kivikautiset asuinpaikat, vaikka alueen arkeologiseen perintöön kuuluu myös historiallisen ajan kohteita. Vaikutukset tulee arvioida erityisesti Simolan Rantavainion (mj-tunnus 980010011) ja Kaskilahden (980010006) kivikautisten asuinpaikkojen osalta. Niiden alueella kaavakartassa on tiemerkintöjä, jotka ovat ristiriidassa muinaismuistolain kanssa. Uudet tieyhteydet on ensisijaisesti sijoitettava muinaisjäännösten ulkopuolelle, museoviranomaisen riittäväksi toteamalle etäisyydelle. Tierakentamisen suunnittelu muinaisjäännösalueelle tai sen läheisyyteen vaatii pääsääntöisesti arkeologisten kaivaustutkimusten suorittamista kaavahankkeen yhteydessä. Mikäli kaavaehdotusta ei muuteta em. tiemerkintöjen osalta, tulee niistä neuvotella hyvissä ajoin ennen kaavan hyväksymiskäsittelyä museoviranomaisen kanssa MML 13 §:n mukaisesti. Vaikutusten arvioinnin rakenteen osalta maakuntamuseo kiinnittää huomiota myös siihen, että arkeologinen kulttuuriperintö tulee käsitellä rakennetun kulttuuriympäristön ja kulttuurimaiseman rinnalla osana kulttuuriympäristöä eikä luvussa "Vaikutukset rakennettuun ympäristöön".

Maakuntamuseon edellisessä lausunnossaan toteamat kaavamerkintöjä ja -määräyksiä koskevat täydennys- ja korjaustarpeet on huomioitu vain osittain. S-merkinnän (Suojeltava kohde tai muistomerkki) määräystä tulee kuitenkin vielä täydentää lauseella, joka velvoittaa neuvottelemaan museoviranomaisen kanssa aluetta koskevista suunnitelmista. Kulttuuriympäristön arvoalueista puuttuvat kartalta edelleen Kyöstilän ja Kaiharin alueet. Kaavakartalla tulee näkyä kaikki inventoinnissa todetut keskeiset arvot, ei ainoastaan maakunnallisesti arvokkaat aluekokonaisuudet.

Rakennetun ympäristön kohdemerkintään tulee liittää asianmukainen määräys, jossa edellytetään kohteen arvojen huomioon ottamista ja säilymisedellytysten turvaamista. Kohdeluettelossa Ylisen muuntaja nro 13 tulee otsikoida: Ylisten tila ja keskuslaitos. Kohteita koskevan merkinnän ja kohdetietojen yhdistäminen on vaikeaa ja maakuntamuseo esittää uudelleen, että kaikkiin kulttuurihistoriallisesti arvokkaisiin kohteisiin merkitään indeksi, joka viittaa kohdeluetteloon ja edelleen kaavan selvityksenä käytettyyn rakennusinventointiin.

Museovirasto on vuonna 2015 antanut uuden maaseudun historiallisia asuinpaikkoja koskevan ohjeen, jonka mukaan 1750-lukua nuoremmat torpat tulkitaan pääsääntöisesti muiksi arkeologisiksi kulttuuriperintökohteiksi. Torppien paikat voivat myös olla vanhoja kylän- tai tilanpaikkoja, joita koskee muinaismuistolain rauhoitus; asian selvittäminen vaatii kuitenkin tapauskohtaisia tutkimuksia. Tämän vuoksi maakuntamuseo esittää, että vuoden 2009 inventoinnissa kohteiden 40 (Huhkaan kylätontti) ja 42 (Mutalan kylätontti) yhteydessä paikannetut, autioituneet torpanpaikat merkitään kaavaan edellä mainitulla s-kohdemerkinnällä (ks. inventointiraportin s. 8 ja 15).

Ylöjärven kaavoitus on toimittanut maakuntamuseolle tiedoksi 30.8.2012 saamansa muistutuksen, jossa mainitaan Vahannan alueella sijaitseva, muinaisjäännösrekisteristä puuttuva kiviröykkiö. Koska kyseessä on mahdollinen kiinteä muinaisjäännös tai muu arkeologinen kohde, maakuntamuseo tulee noin kuukauden sisällä suorittamaan virkatyönään kohteen tarkastuksen ja ilmoittaa kaavoittajalle tarkastuksen tuloksista sekä kohteen mahdollisesta kaavaan merkitsemisen tarpeesta.

Lisäksi maakuntamuseo huomauttaa ristiriidasta Liimolan kulttuurihistoriallisesti arvokkaan rakennetun ympäristön ja sen rantapellon MY-3 alueen kupeeseen osoitettujen uusien rantarakennuspaikkojen välillä. Suunnitelmaa tulee vielä tarkistaa näiltä osin. Kaavakartalle /s-merkinällä merkittyä Tiuran tilakeskusta ei ole esitetty inventoinnissa eikä arvokohteiden kohdeluettelossa. Kohteen tiedot tulee liittää liitekartalle.

Tarkistettu kaava-aineisto tulee toimittaa Pirkanmaan maakuntamuseolle nähtäväksi. Myös kaavan hyväksymispäätös valitusosoituksineen tulee lähettää Pirkanmaan maakuntamuseoon viipymättä.